四川工商职业技术学院有5个系，分别是轻化工程系、机电工程系、信息工程系、管理工程系。

轻化工程系

食品生物技术、印刷技术、制浆造纸技术、材料工程技术、环境监测与治理技术、工业分析与检测、食品营养与检测、包装技术与设计。

机电工程系

模具设计与制造、机电一体化技术、电子信息工程、电气自动化技术、包装自动化技术、机电设备运行与维护、汽车检测与维修技术。

信息工程系

电子商务、计算机网络技术、计算机信息管理、计算机应用技术、软件技术、动漫设计与制作、软件技术（手机游戏方向）、软件技术（网站（Web）应用开发方向）、软件技术（桌面应用开发方向）。

管理工程系

旅游管理、饭店服务与管理方向、财务管理、会计电算化、工商企业管理、市场营销、物流管理、连锁经营管理。